Chapter5連鎖遺傳規(guī)律
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1、單擊此處編輯母版標(biāo)題樣式,,單擊此處編輯母版文本樣式,,第二級(jí),,第三級(jí),,第四級(jí),,第五級(jí),,,*,*,Chapter5 連鎖遺傳規(guī)律,位于一對(duì)同源染色體上的,非等位基因,間的遺傳關(guān)系以及性染色體上基因的遺傳,,1,,連鎖遺傳理論的由來(lái),W. Bateson(1906)在香豌豆兩對(duì)相對(duì)性狀雜交試驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),連鎖遺傳(linkage)現(xiàn)象,。,,摩爾根:,,美國(guó)生物學(xué)家與遺傳學(xué)家,現(xiàn)代實(shí)驗(yàn)生物學(xué)奠基人。,,T. H. Morgan et al.(1910),提出連鎖遺傳規(guī)律以及連鎖與交換的遺傳機(jī)理,并創(chuàng)立基因論,(theory of the gene),。,,2,,Chapter5 連鎖遺傳,5
2、.1,,連鎖與交換,,5.2,,交換值及其測(cè)定,,5.3,,基因定位與連鎖遺傳圖,,5.4,,真菌類(lèi)的連鎖與交換,,5.5,,連鎖遺傳規(guī)律的應(yīng)用,,本章要點(diǎn),,3,,5.1 連鎖與交換,5.1.1連鎖遺傳現(xiàn)象,,5.1.2連鎖遺傳的解釋,,5.1.3完全連鎖與不完全連鎖,,5.1.4交換與不完全連鎖的形成,,5.1.5重組型配子的比例,,5.1.6交換的細(xì)胞學(xué)證據(jù),,,4,,5.1.1連鎖遺傳現(xiàn)象,(p72-73),1.香豌豆(Lathyrus odoratus)兩對(duì)相對(duì)性狀雜交試驗(yàn).,,1)兩對(duì)相對(duì)性狀,,花色:紫 (P) →紅 (p) 為顯性;,,花粉粒形狀:長(zhǎng) (L) →圓 (l) 為顯
3、性。,,2)兩種組合,,組合1:紫、長(zhǎng)×紅、圓,.,,組合2:紫、圓×紅、長(zhǎng),.,,5,,組合1:紫花、長(zhǎng)花粉?!良t花、圓花粉粒,,6,,組合2:紫花、圓花粉?!良t花、長(zhǎng)花粉粒,,7,,組合1和2的實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析,結(jié)果:,,F1 →兩對(duì)相對(duì)性狀→→顯性,F(xiàn)2 →4表現(xiàn)型;,,每對(duì)等位基因的別離比例都符合3:1,,F2 :4種表現(xiàn)型比例與9:3:3:1相差很大,,親本組合 的實(shí)際數(shù)>理論數(shù),,,新組合 的實(shí)際數(shù)<理論數(shù)。,,8,,5.1.1連鎖遺傳,(linkage),現(xiàn)象,2.,連鎖遺傳:,,雜交試驗(yàn)中,原來(lái)為同一親本所具有的兩個(gè)性狀在,F,2,中不符合獨(dú)立分配規(guī)律,而常有,連在一起,遺傳的傾向
4、。,,1)相引相:兩個(gè)顯性性狀聯(lián)系在一起遺傳,而兩個(gè)隱性性狀聯(lián)系在一起的雜交組合。,,例:,PL,/,pl,,2)相斥相:1顯性性狀和1隱性性狀聯(lián)系在一起遺傳。,,例:,Pl,/,pL,。,,,,,P,p,L,l,,,,,P,p,l,L,,9,,5.1.2連鎖遺傳的解釋,為什么F2不表現(xiàn)9:3:3:1的表現(xiàn)型別離比例。,,1.每對(duì)相對(duì)性狀是否符合別離規(guī)律?,,2.非等位基因間是否符合獨(dú)立分配規(guī)律?,,3.摩爾根等的果蠅遺傳試驗(yàn);,,4.連鎖遺傳現(xiàn)象的解釋。,,10,,1.每對(duì)相對(duì)性狀是否符合別離規(guī)律?,,11,,2.,非等位基因間是否符合獨(dú)立分配規(guī)律?,-----測(cè)交法,赫欽森,(C. B.
5、Hutchinson, 1922),玉米(籽粒)測(cè)交試驗(yàn),,顏色:,,有色,(C),、無(wú)色(,c,),,飽滿程度:,飽滿,(Sh),、凹陷,(sh),,(分別做了相引相和相斥相的測(cè)交試驗(yàn)。),,(測(cè)交法:測(cè)定雜種,F,1,產(chǎn)生配子的種類(lèi)和比例),,12,,測(cè)交:相引相,P,有色飽滿,×,無(wú)色凹陷,,CCShSh,,ccshsh,,↓,,,測(cè)交 F,1,有色飽滿,×,無(wú)色凹陷,,CcShsh ccshsh,,↓ ↓,,↓,,↓,,配子,CSh,Csh,cSh,csh,csh,總數(shù),測(cè)交子代(F,t,),CcShsh
6、,,有色飽滿,Ccshsh,,有色凹陷,ccShsh,,無(wú)色飽滿,Ccshsh,,無(wú)色凹陷,,,實(shí)得粒數(shù),4032,149,152,4035,,8368,百分比%,48.2,1.8,1.8,48.2,,,測(cè)交后代中,親本組合=(4032+4035)/8368×100%=96.4%,,重新組合=(149+152)/8368×100%=3.6%,,,,,,,13,,測(cè)交:相斥相,P,有色,凹陷,×,無(wú)色,飽滿,,CCshsh,,ccShSh,,↓,,,測(cè)交 F,1,有色飽滿,×,無(wú)色凹陷,,CcShsh ccshsh,,↓
7、 ↓,,↓,,↓,配子,CSh,Csh,cSh,csh,csh,總數(shù),測(cè)交子代(F,t,),CcShsh,,有色飽滿,Ccshsh,,有色凹陷,ccShsh,,無(wú)色飽滿,Ccshsh,,無(wú)色凹陷,,,實(shí)得粒數(shù),638,21379,21096,672,,43785,百分比%,1.5,48.5,48.5,1.5,,,測(cè)交后代中,親本組合=(21379+21096)/43785×100%=97%,,重新組合=(638+672)/43785×100%=3%,,,,,,,14,,測(cè)交法的試驗(yàn)結(jié)果分析,F1:4種配子比例≠1:1:1:1;,,親本型配子比例>50%,重組型配子比例<50%;,,親本型
8、配子數(shù)根本相等,重組型配子數(shù)也根本相等。,,15,,3.,摩爾根等的果蠅遺傳試驗(yàn),果蠅,(,Drosophila melanogaster,),眼色,與,翅長(zhǎng),的連鎖遺傳:,,眼色:紅 (pr,+,),→,紫 (pr)為顯性;,,翅長(zhǎng):長(zhǎng) (vg,+,),→,殘 (vg)為顯性。,,16,,果蠅眼色與翅長(zhǎng)連鎖遺傳:相引相,P pr,+,pr,+,vg,+,vg,+,×,prprvgvg,,,↓,,F,1,pr,+,prvg,+,vg,×,prprvgvg(,測(cè)交,),,,↓,O E(1:1:1:1),,F,t,pr,+,vg,+,,1339,709.75,,prvg,1
9、195,709.75,,pr,+,vg 151,709.75,,prvg,+,154,709.75,,,17,,果蠅眼色與翅長(zhǎng)連鎖遺傳:相斥相,P pr,+,pr,+,vgvg,×,prprvg,+,vg,+,,,↓,,F,1,pr,+,prvg,+,vg,×,prprvgvg(,測(cè)交,),,↓,O E(1:1:1:1),,F,t,pr,+,vg,+,157 583.75,,prvg 146 583.75,,pr,+,vg,965,583.75,,prvg,+,,1067,583.75,,18
10、,,引相和相斥相的雜交與測(cè)交試驗(yàn)結(jié)果,F,1,:4種配子;,,比例,≠,,1:1:1:1,,且親本類(lèi)型配子>重組型配子;,,親本型配子數(shù)大致相等,重組型配子數(shù)也大致相等。,,19,,4.,連鎖遺傳現(xiàn)象的解釋,連鎖遺傳規(guī)律,:,,連鎖遺傳的相對(duì)性狀是由位于同一對(duì)染色體上的,非等位基因,控制,具有連鎖關(guān)系,在形成配子時(shí)傾向于連在一起傳遞。,交換型配子,是由于,非姊妹染色單體間交換,形成的。,,20,,5.1.3,,完全連鎖和不完全連鎖,1.,完全連鎖,(complete linkage),:,,如果連鎖基因的雜種,F,1,(,雙雜合體,),只產(chǎn)生兩種親本類(lèi)型的配子,而,不產(chǎn)生非親本類(lèi)型的配子,,就
11、稱(chēng)為完全連鎖。,,連鎖:若干非等位基因位于同一染色體而發(fā)生聯(lián)系遺傳的現(xiàn)象。,,21,,完全連鎖,(complete linkage),完全連鎖:自交,→,3:1; 測(cè)交,→1:1,?,,22,,擬等位基因,擬等位基因,(pseudoalleles),,完全連鎖的、控制同一性狀的非等位基因。,,與完全連鎖的區(qū)別:,,擬等位基因突變體相互雜交的F,1,在功能上得到互補(bǔ),表現(xiàn)為野生型。,,23,,2.不完全連鎖,不完全連鎖,(incomplete linkage),:,,指連鎖基因的雜種,F,1,不僅產(chǎn)生親本類(lèi)型的配子,還會(huì)產(chǎn)生,重組型配子,。,,1)交換:成對(duì)染色體非姐妹染色單體間基因的互換
12、。,,2),重組型,(intrachromosomal recombinant)/交換型(crossover type),,因交換形成的新基因組合,是同源染色體的非姊妹染色體間交換的結(jié)果。,,24,,3)重組(recombination):產(chǎn)生新基因組合或染色體組合的過(guò)程。重組分為兩類(lèi):,,染色體間重組:是,非同源染色體間,的自由組合。,,推斷依據(jù):產(chǎn)生的各類(lèi)型配子的比例相等.,,染色體內(nèi)重組,:是同源染色體間片段交換的結(jié)果。,,標(biāo)志:重組型配子小于配子總數(shù)的一半。,5.1.3,,完全連鎖和不完全連鎖,,25,,不完全連鎖--,相引相,,(incomplete linkage),,26,,不完
13、全連鎖--,相斥相,,(incomplete linkage),,27,,5.1.4交換與不完全連鎖的形成,(p95),重組合配子的產(chǎn)生是由于:,,減數(shù)分裂前期,I,,同源染色體的,非姊妹染色單體,間發(fā)生了節(jié)段互換。,(,基因論的核心內(nèi)容,),,28,,5.1.5重組型配子的比例,重組型配子比例:,,是,發(fā)生交換的孢母細(xì)胞比例,的一半,,并且兩種重組型配子的比例相等,兩種親本型配子的比例相等。,,29,,連鎖與交換的遺傳機(jī)理,,30,,5.1.6交換的細(xì)胞學(xué)證據(jù),1.交叉和交換的關(guān)系,,減數(shù)分裂同源染色體聯(lián)會(huì)的交叉形態(tài)是細(xì)胞學(xué)上可觀察到的染色體片段交換的證據(jù),,1978年C.Tease和G.H
14、.Jones利用,姊妹染色單體分化染色技術(shù),直接證明了交叉是交換的地方。,,2.染色體交換理論--染色體交換機(jī)制的假說(shuō),,斷裂-重接模型,(breakage and reunion model),,拷貝模型(copy choice model),,31,,,32,,雙線期,,與,,早中期,(,示意圖,),,33,,中期,I,與,,后期,I (,示意圖,),,34,,5.2,交換值及其測(cè)定,5.2.1,,交換值的概念,,5.2.2,,交換值的測(cè)定,,5.2.3交換值與遺傳距離,,5.2.4,影響交換值的因素,,35,,5.2.1,,交換值的概念,(p97),交換值,(cross-over val
15、ue),,也稱(chēng)重組率,/,重組值,是指重組型配子占總配子的百分率。即:,親本型配子,+,重組型配子,?:用哪些方法可以測(cè)定各種配子的數(shù)目,,36,,5.2.2,,交換值的測(cè)定,1.,測(cè)交法,,測(cè)交后代,(F,t,),的表現(xiàn)型的種類(lèi)和比例直接反映被測(cè)個(gè)體,(,如,F,1,),產(chǎn)生配子的種類(lèi)和比例。,,2.,自交法,,簡(jiǎn)易法,,最大可能性法,,乘積法,,37,,測(cè)交法--(1),,38,,相斥相,,39,,簡(jiǎn)易法--( 2 ),假定基因A/a,B/b連鎖,雌雄配重組頻率相同。,,令,Rf=p,,相引相組合:,AB,/,AB,×,ab,/,ab,→F,1,,AB,/,ab,,?,,相斥相組合:,A,
16、b,/,A,b,×,a,B,/,a,B,→F,1,,A,b,/,a,B,,?,,40,,(2)簡(jiǎn)易法--相引相,♀ ♂,AB 1/2(1-p),aB 1/2p,Ab 1/2p,ab 1/2 (1-p),AB,AB/AB,AB/aB,AB/Ab,AB/ab,1/2(1-p),1/4(1-p),2,1/4(1-p)p,1/4(1-p)p,1/4(1-p),2,aB,aB/AB,aB/AB,aB/Ab,aB/ab,1/2p,1/4(1-p)p,1/4p,2,1/4p,2,1/4(1-p)p,Ab,Ab/AB,Ab/AB,Ab/Ab,Ab/Ab,1/2p,1/4(1-p)p,1/4p,2
17、,1/4p,2,1/4(1-p)p,ab,ab/AB,ab/aB,ab/Ab,ab/ab,1/2(1-p),1/4(1-p),2,1/4(1-p)p,1/4(1-p)p,1/4(1-p),2,,41,,最大可能性法--(3),假定雌雄配子的重組率相同,,各表型個(gè)體數(shù):,,A_B_:,a,; A_bb:,b,; aaB_:,c,; aabb:,d,,n,→,F,2,個(gè)體總數(shù),k,→,正值,q=1-p,當(dāng)雌雄個(gè)體重組頻率不同時(shí):,,42,,一切參數(shù)同方法(3),,K只取小值,乘積法--(4),,43,,5.2.3交換值與遺傳距離,1.,非姊妹染色單體間,交換數(shù)目,及,位置,是隨機(jī)的;,,2.,兩個(gè)
18、連鎖基因間交換值的變化范圍是,[0, 50%],,其變化反映基因間的,連鎖強(qiáng)度,、,基因間的相對(duì)距離,;,,兩基因間的距離越遠(yuǎn),基因間的連鎖強(qiáng)度越小,交換值就越大。,,3.,通常用交換值,/,重組率來(lái)度量基因間的,相對(duì)距離,,也稱(chēng)為,遺傳距離,(genetic distance),。,,遺傳距離單位,/,遺傳單位:,1%,的重組率。,,44,,基因間的距離與交換值、遺傳距離、連鎖強(qiáng)度,,45,,5.2.4影響交換值的因素,1.,基因位于染色體上的部位,不同,重組率有差異。,,離著絲點(diǎn)越近,其交換值越小,著絲點(diǎn)不發(fā)生交換。,,2.,性別,對(duì)交換值的影響,,雄果蠅,和,雌家蠶,的進(jìn)行減數(shù)分裂時(shí)很
19、少發(fā)生交換,。,,46,,5.2.4影響交換值的因素,3.,溫度:家蠶第二對(duì)染色體上P,S,-Y(P,S,黑斑、Y幼蟲(chóng)黃血),,飼養(yǎng)溫度(℃) 30 28 26 23 19交換值(%) 21.48 22.34 23.55 24.98 25.86,,原因:極端溫度能誘發(fā)正常條件下不發(fā)生交換區(qū)域發(fā)生交換,,4.,其它:年齡、染色體畸變、二價(jià)離子和輻射等也會(huì)影響交換值。,,47,,5.3,,基因定位與連鎖遺傳圖,(,基因定位的含義與層次,),,5.3.1連鎖分析的方法,,5.3.2干擾和符合,,5.3.3連鎖遺傳圖,,48,,基因定位,(gene location/l
20、ocalization),基因定位,(gene location/localization),:確定基因在染色體上的相對(duì)位置和排列次序。,,根據(jù)兩個(gè)基因位點(diǎn)間的交換值能夠,確定兩個(gè)基因間的相對(duì)距離,,但并不能確定基因間的排列次序。,,例:玉米糊粉層:有色,C/,無(wú)色,c,、籽粒飽滿,Sh/,凹陷,sh,,位于第9染色體上;,C-Sh,間的交換值=,3.6%,。,,49,,兩對(duì)基因間的排列次序,根據(jù)上述信息可知:,,C-Sh間遺傳距離為3.6個(gè)遺傳單位;,,但不能確定它們?cè)谌旧w上的排列次序,因而有兩種可能的排列方向,如以下圖所示:,,50,,基因定位的層次,廣義的基因定位有三個(gè)層次:,,染色體
21、定位,(,單體、缺體、三體定位法,),;,,染色體臂定位,(,端體分析法,),;,,連鎖分析,(linkage analysis),。,,51,,5.3.1,,連鎖分析的方法,1.,兩點(diǎn)測(cè)驗(yàn),(two-point testcross),,2.,三點(diǎn)測(cè)驗(yàn),(three-point testcross),,一次測(cè)驗(yàn)就考慮三對(duì)基因的差異,從而通過(guò),一次測(cè)驗(yàn),獲得三對(duì)基因間的距離并確定其排列次序。,,52,,兩點(diǎn)測(cè)驗(yàn):步驟,(1/3),1. 通過(guò),三次親本間兩兩雜交,,雜種F,1,與雙隱性親本測(cè)交,考察測(cè)交子代的類(lèi)型與比例。,,例:玉米第9染色體上三對(duì)基因間連鎖分析:,,子粒顏色: C →c,顯性;,
22、,飽滿程度:飽滿(Sh) →凹陷(sh),顯性;,,淀粉粒: 非糯性(Wx) →糯性(wx),顯性.,,53,,,兩點(diǎn)測(cè)驗(yàn)(,C-Sh,)—試驗(yàn)(1)測(cè)交結(jié)果,P,,CCShSh,有色、飽滿 ×,ccshsh,無(wú)色、凹陷,,↓,,,F,1,,CcShsh,有色飽滿 ×,ccshsh,無(wú)色、凹陷,,↓,,F,t,,C_Sh_ C_shsh ccSh_ ccshsh,,有色飽滿? 有色凹陷? 無(wú)色飽滿?? 無(wú)色凹陷,,個(gè)數(shù)? 4032?????? 149?????? 152??????? 4035,,交換值=,(149+152
23、)/8368×100,%,=3.6%,,,54,,兩點(diǎn)測(cè)驗(yàn)(,Wx-Sh,)—試驗(yàn)(2)測(cè)交結(jié)果,交換值=(1531+1488)/(1531+5991+5885+1488)×100%=20%,,55,,兩點(diǎn)測(cè)驗(yàn)(,Wx-C,)—試驗(yàn)(3)測(cè)交結(jié)果,交換值=(739+717)/(2542+739+717+2716)×100%=22%,,,56,,兩點(diǎn)測(cè)驗(yàn):步驟,(2/3),2.,計(jì)算三對(duì)基因兩兩間的交換值,估計(jì)基因間的遺傳距離。,,C-Sh:,交換值=,3.6%,,,Wx-Sh:,交換值=,20%,,Wx-C:,交換值=,22%,,,57,,兩點(diǎn)測(cè)驗(yàn):步驟,(3/3),3.,根據(jù)基因間的遺傳距離
24、,確定基因間的排列次序,并作連鎖遺傳圖譜。,,C-Sh: 3.6,Wx-Sh: 20,,Wx-C: 22,,第一種,,,,,,第二種,,,,第三種,,Wx Sh C,Wx C Sh,Wx C Sh,,58,,兩點(diǎn)測(cè)驗(yàn):局限性,1.,工作量大,需要作三次雜交,三次測(cè)交;,,2.,不能排除雙交換的影響,準(zhǔn)確性不夠高。
25、,當(dāng)兩基因位點(diǎn)間超過(guò)五個(gè)遺傳單位時(shí),兩點(diǎn)測(cè)驗(yàn)的準(zhǔn)確性就不夠高。,C,B,A,c,b,a,C,B,A,c,b,a,c,B,A,C,b,a,雙交換類(lèi)型,,59,,三點(diǎn)測(cè)驗(yàn):步驟,(1/7-2/7),以玉米C/c、Sh/sh、Wx/wx三對(duì)基因連鎖分析為例,,,在描述時(shí)用“+〞代表各基因?qū)?yīng)的顯性基因。,,1.用三對(duì)性狀差異的兩個(gè)純系作親本進(jìn)行雜交、測(cè)交;,,2.考察測(cè)交后代的表現(xiàn)型、進(jìn)行分類(lèi)統(tǒng)計(jì)。,(在不完全連鎖的情況下測(cè)交后代有多少種表現(xiàn)型?),,60,,,3.,按各類(lèi)表現(xiàn)型的個(gè)體數(shù),對(duì)測(cè)交后代進(jìn)行分組;,,4.,進(jìn)一步確定兩種親本類(lèi)型和兩種雙交換類(lèi)型;,三點(diǎn)測(cè)驗(yàn):步驟,(3/7-4/7),,6
26、1,,,(1),,(2),,(3),,(4),,(5),,(6),,(7),,(8),,,62,,三點(diǎn)測(cè)驗(yàn):步驟,(5/7),5. 確定三對(duì)基因在染色體上的排列順序。,,用兩種親本型配子與兩種雙交換型配子比較:雙交換配子與親本型配子中不同的基因位點(diǎn)位于中間。,,如以下圖所示:,雙交換,,類(lèi)型,wx,c,sh,+,+,+,wx,c,+,+,+,sh,親本,,類(lèi)型,+ wx c與sh wx c相比只有sh位點(diǎn)不同,因此可以斷定,sh,位點(diǎn)位于wx和c之間;,,63,,基因間排列順序確定,,64,,三點(diǎn)測(cè)驗(yàn):步驟,(6/7),類(lèi)型,根據(jù)F,t,表現(xiàn)型推知F,1,配子基因型,粒數(shù),交換類(lèi)別,(1),
27、+ wx c,2708,親本型,(2),Sh + +,2538,親本型,(3),+ + c,626,單交換,(4),Sh wx +,601,單交換,(5),sh + c,113,單交換,(6),+ wx +,116,單交換,(7),+ + +,4,雙交換,(8),sh wx c,2,雙交換,,,6708,,sh-c,之間的重組類(lèi)型: (5),(6),(7),(8),,Rf=113+116+4+2/6708×100%=,3.5%,,65,,三點(diǎn)
28、測(cè)驗(yàn):步驟,(6/7),類(lèi)型,根據(jù)F,t,表現(xiàn)型推知F,1,配子基因型,粒數(shù),交換類(lèi)別,(1),+ wx c,2708,親本型,(2),Sh + +,2538,親本型,(3),+ + c,626,單交換,(4),Sh wx +,601,單交換,(5),sh + c,113,單交換,(6),+ wx +,116,單交換,(7),+ + +,4,雙交換,(8),sh wx c,2,雙交換,,,6708,,wx-sh,之間的重組類(lèi)型,:,(3),(
29、4),(7),(8),,Rf=626+601+4+2/6708×100%=,18.4%,,66,,類(lèi)型,根據(jù)F,t,表現(xiàn)型推知F,1,配子基因型,粒數(shù),交換類(lèi)別,(1),+ wx c,2708,親本型,(2),Sh + +,2538,親本型,(3),+ + c,626,單交換,(4),Sh wx +,601,單交換,(5),sh + c,113,單交換,(6),+ wx +,116,單交換,(7),+ + +,4,雙交換,(8),sh wx
30、c,2,雙交換,,,6708,,wx-c,之間的重組類(lèi)型: (3),(4),(5),(6),,Rf=626+601+113+116/6708×100%=,21.7%,三點(diǎn)測(cè)驗(yàn):步驟,(6/7),,67,,三點(diǎn)測(cè)驗(yàn):步驟,(7/7),7.,繪制連鎖遺傳圖。,,Sh,位于,wx,與,c,之間;,,wx-sh: 18.4 sh-c: 3.5 wx-c:21.7,,68,,*兩個(gè)思考問(wèn)題:,1.三點(diǎn)測(cè)驗(yàn)考慮到了wx與c之間的雙交換值,應(yīng)該比兩點(diǎn)測(cè)驗(yàn)得到的遺傳距離更大。但事實(shí)上還是變小了,為什么?,,2.各種方法在各次試驗(yàn)中測(cè)定的交換值-遺傳距離都不相同,倒底哪一個(gè)最能反映基因間的遺傳距離?如何選擇?,
31、,69,,雙交換與染色體作圖,雙交換值= (4+2)/6708×100% =,0.09%,,wx-c間單交換:,,Rf,=(601+626+116+113)/6708×100%+,2,×0.09%,,=,21.9%,由于,雙交換實(shí)際上在兩個(gè)區(qū)域均發(fā)生交換,,所以在估算每個(gè)區(qū)域交換值時(shí),都應(yīng),加上雙交換值,,才能夠正確地反映實(shí)際發(fā)生的交換頻率。,,70,,5.3.2,,干擾和符合,1.,理論雙交換值,,雙交換發(fā)生的理論頻率,(,理論雙交換值,),應(yīng)該是,兩個(gè)區(qū)域,交換頻率,(,交換值,),的,乘積,。,,條件:相鄰兩交換間互不影響,即交換,獨(dú)立發(fā)生,,例:,wxshc,三點(diǎn)測(cè)驗(yàn)中,,wx,和,c
32、,基因間理論雙交換值應(yīng)為:,,0.184,×,0.035=0.64%,。,,71,,5.3.2,,干擾和符合,2. 干擾(interference,I):,,一個(gè)交換發(fā)生后,它往往會(huì)影響其鄰近交換的發(fā)生。其結(jié)果是使實(shí)際雙交換值不等于理論雙交換值。,,測(cè)交試驗(yàn)的結(jié)果說(shuō)明:,,wx和c:實(shí)際雙交換值=0.09%,低于理論雙交換值,,原因:wx-sh間或sh-c間一旦發(fā)生一次交換后就會(huì)影響另一個(gè)區(qū)域交換的發(fā)生,使雙交換的頻率下降。,,72,,符合系數(shù),(coefficient of coincidence),符合(并發(fā))系數(shù)(C):,,用以衡量?jī)纱谓粨Q間相互影響的,性質(zhì)和程度,。,例:,C=0.09
33、/0.64=0.14,,符合系數(shù)的性質(zhì):,,真核生物:,[0,1]—,正干擾,;,,*某些微生物中往往大于,1,,稱(chēng)為,負(fù)干擾,。,,73,,5.3.3連鎖遺傳圖,(linkage map),連鎖遺傳圖(linkage map),遺傳圖譜(genetic map)。,,遺傳作圖(mapping).,,連鎖群(linkage group);,,數(shù)目:存在于同一染色體上的全部基因.,,一種生物連鎖群數(shù)目與染色體對(duì)數(shù)一致,也可暫時(shí)少于或多于染色體對(duì)數(shù),,遺傳作圖的過(guò)程與說(shuō)明。,,連鎖遺傳圖繪制的根本過(guò)程;,,大于50個(gè)遺傳單位的遺傳距離說(shuō)明什么?,,74,,玉米的連鎖遺傳圖,,75,,5.4,,真菌
34、類(lèi)的連鎖與交換,5.4.1無(wú)序四分子分析作圖,,,5.4.2有序四分子分析與著絲點(diǎn)作圖,,,5.4.3紅色面包霉的連鎖與交換,,,76,,四分子分析(tetrad analysis),有序四分子分析,(tetrad analysis):,,指根據(jù)一個(gè)子囊中四個(gè)按,嚴(yán)格順序,直線排列的四分子表現(xiàn)進(jìn)行的遺傳分析,也稱(chēng)為有序四分子分析。,,*,無(wú)序四分子分析,(unordered terad analysis):,,四分子沒(méi)有嚴(yán)格排列順序,如酵母菌。,,77,,1.兩個(gè)連鎖基因的作圖,a b,×,++,,,↓,,a b a +,,a b,,a b a +
35、a +,,,,+ + + b + b,,+ + + b + +,,,,類(lèi)型:,,PD NPD TT,,圖:無(wú)序四分子三種可能的類(lèi)型,*連鎖的標(biāo)志: PD >>NPD,《5.4.1無(wú)序四分子分析作圖》,,78,,b,a,a,b,ab,,ab,+,+,+,+,++,,++,PD,a+,,++,ab,,+b,a,b,b,+,+,+,+,a,TT,a,a,+,+,+,+,b,b,a+,,a+,+b,,+b,NPD,圖: 減數(shù)分裂中,中期染色體的不同 排列 形成三種不同類(lèi)型的四分體,《5
36、.4.1無(wú)序四分子分析作圖》,,79,,a b,+ +,a b,+ +,NCO,ab,,ab,,++,,++,a b,+ +,a b,+ +,SCO,ab,,a+,,+b,,++,a b,+ +,a b,+ +,DCO-雙線,ab,,ab,,++,,++,a
37、 b,+ +,a b,+ +,DCO-四線,a+,,a+,,+b,,+b,a b,+ +,a b,+ +,DCO-三線,ab,,a+,,++,,+b,a b,+ +,a b,+ +,DCO-三線,a+,,ab,,+b,,++,PD,PD,TT,TT,TT,NPD,《5.4.1無(wú)序四分子分析作圖》,,80,,++,++
38、,ab,,ab,+b,++,ab,,a,+,++,++,ab,,ab,++,a+,ab,,+,b,++,a+,ab,,+,b,++,a+,ab,,+,b,《5.4.1無(wú)序四分子分析作圖》,,81,,ab兩個(gè)基因之間的Rf=?,,,,,這樣計(jì)算能反映真實(shí)的遺傳距離嗎?,,應(yīng)為:,,m=(a-b)SCO+2(a-b)DCO,,由上圖可知:,,DCO=4NPD,,SCO=TT-,1/2,DCO=TT-2NPD,,m=TT+6NPD,,圖距=50×(TT+6NPD),《5.4.1無(wú)序四分子分析作圖》,,82,,2.三個(gè)連鎖基因的連鎖作圖,a c
39、b,+ + +,a c b,+ + +,a c b,×,+++,,↓,PD 型,,NPD型,,TT型,*連鎖的標(biāo)志:,,PD >>NPD,確定基因的順序?,,遺傳距離的估計(jì)?,《5.4.1無(wú)序四分子分析作圖》,,83,,a c b,,a c b,,+ + +,,+ + +,(1) NCO,第一類(lèi),PD,,(80%),a c b,,a,+ +,,+,c b,,+ + +,(2)SCO(a-c),a c b,,a c,+,,+ +,b,,+ + +,(3)SCO(c-b),(4)DCO(雙線),a c
40、b,,a,+,b,,+,c,+,,+ + +,第二類(lèi),TT,,(8%),TT,,(7%),TT,,(2%),(5)DCO(三線),(6)DCO(三線),a + b,,a c +,,+ c b,,+ + +,a c b,,a + +,,+ + b,,+ c +,第三類(lèi),TT,,(2%),TT,,(1%),a + +,,a c +,,+ c b,,+ + b,(7)DCO(四線),第四類(lèi),TT,,(0%),《5.4.1無(wú)序四分子分析作圖》,,84,,確定基因的順序?,用兩種親本型配子與兩種雙交換型配子比較:,,雙交換配子與親本型配子中不同的基因位點(diǎn)位于中間。,,比較的結(jié)果說(shuō)明c位于中間,a c b
41、,,a,c,b,,+,+,+,,+ + +,a c b,,a,+,b,,+,c,+,,+ + +,《5.4.1無(wú)序四分子分析作圖》,,85,,遺傳距離的估計(jì)?,Rf(a-c)=1/2(8+2+2+1)=6.5%,,Rf(c-b)=1/2(7+2+2+1)=6.0%,6.0,a,b,c,6.5,《5.4.1無(wú)序四分子分析作圖》,,86,,5.4.2有序四分子分析與著絲點(diǎn)作圖,1.紅色面包霉,(,真菌類(lèi),),的特點(diǎn):,,易于繁殖、培養(yǎng)、管理;,,子囊孢子是單倍體,,表型直接反映基因型,,無(wú)需測(cè)交;,,可獲得、分析,單次減數(shù)分裂,的結(jié)果。,,紅色面包霉減數(shù)分裂特點(diǎn):,,每次減數(shù)分裂結(jié)果,(,四個(gè)分生
42、孢子,或其有絲分裂產(chǎn)生的八個(gè)子囊孢子,),都保存在一個(gè)子囊中;,,四分子或八分子在,子囊中呈直線排列,——,直列四分子,直列八分子,,具有嚴(yán)格的順序,。,,87,,《5.4.2有序四分子分析與著絲點(diǎn)作圖》,紅色面包霉減數(shù)分裂特點(diǎn),,88,,著絲點(diǎn)作圖,(centromere mapping),著絲點(diǎn)作圖(centromere mapping):,,根據(jù)基因與著絲點(diǎn)間的交換值,估計(jì)基因位點(diǎn)與著絲點(diǎn)間遺傳距離,并進(jìn)行連鎖作圖。,,如果減數(shù)分裂過(guò)程中,基因與著絲點(diǎn)間,,不發(fā)生交換:一對(duì)等位基因別離產(chǎn)生的兩種類(lèi)型的孢子將分別排列在子囊的兩端;,,發(fā)生交換:產(chǎn)生不同的排列方式??筛鶕?jù)子囊中孢子排列方式判
43、斷該次減數(shù)分裂是否發(fā)生交換,并計(jì)算交換值。,《5.4.2有序四分子分析與著絲點(diǎn)作圖》,,89,,5.4.3紅色面包霉的連鎖與交換,紅色面包霉有一個(gè)與賴氨酸合成有關(guān)的基因(lys):,,野生型(lys+)——合成lys ,在根本培養(yǎng)基(不含賴氨酸)上正常生長(zhǎng),成熟子囊孢子呈黑色;,,突變型(lys-)——不合成lys ,在根本培養(yǎng)基上生長(zhǎng)緩慢,子囊孢子成熟較遲,呈灰色。,,用不同接合型的lys+和lys-雜交,,,預(yù)期八個(gè)孢子中l(wèi)ys+:lys-=4:4。,,在對(duì)子囊進(jìn)行鏡檢時(shí)發(fā)現(xiàn)子中l(wèi)ys+和lys-有6種排列方式。,,90,,六種子囊孢子排列方式,+,,+,,+,,+,,-,,-,,-,,-
44、,-,,-,,-,,-,,+,,+,,+,,+,-,,-,,+,,+,,+,,+,,-,,-,+,,+,,-,,-,,+,,+,,-,,-,+,,+,,-,,-,,-,,-,,+,,+,-,,-,,+,,+,,-,,-,,+,,+,非交換型,交換型,,91,,李桂玲,第一次分裂別離,非交換型子囊的形成,第一次分裂別離(first division segregation) :lys+和lys-在 MI 彼此別離。,,(1-2)2種排列方式,,著絲粒和lys間不發(fā)生非姊妹染色單體交換,子囊類(lèi)型→非交換型。,,92,,第二次分裂別離,交換型子囊的形成,第二次分裂別離(second division
45、 segregation) : lys+和lys-在MII 發(fā)生別離。,,(3-6)4種排列方式,,著絲粒與lys間發(fā)生交換,子囊→交換型。,,93,,著絲點(diǎn)距離與著絲點(diǎn)作圖,著絲點(diǎn)距離:計(jì)算基因位點(diǎn)與著絲點(diǎn)間的交換值,,來(lái)估計(jì)基因與著絲點(diǎn)間的遺傳距離。,,1交換型子囊中,基因位點(diǎn)與著絲粒間發(fā)生1次交換,其中,半數(shù)孢子是重組型,(,重組型配子,),。因此,交換值的計(jì)算公式為:,,94,,當(dāng)兩對(duì)以上等位基因別離時(shí),有序四分子分析不僅可以確定它們與著絲粒的遺傳距離,還可以分析它們之間是否連鎖。,a的MII別離方式與b的MII別離方式相互獨(dú)立,假設(shè)a與b兩個(gè)位點(diǎn),它們的關(guān)系僅有3種可能性:,,a,b
46、,(1),a,b,(2),a,b,(3),著絲粒與靠近它的一個(gè)基因間的交換將產(chǎn)生兩個(gè)基因都為MII別離方式的子囊,,95,,表:ab×++雜交的子囊類(lèi)型和數(shù)目,,,,,,,,子囊類(lèi)型,,,,,孢,,子,,對(duì),,①,②,③,④,,1-2,ab,a+,ab,ab,,3-4,ab,a+,a+,++,,5-6,++,+b,+b,ab,,7-8,++,+b,++,++,數(shù)目,,210,5,125,60,分類(lèi),,PD,NPD,TT,PD,a分離,,MI,MI,MI,MII,b分離,,MI,MI,MII,MII,問(wèn)題:試分析兩基因之間連鎖關(guān)系和遺傳距離,確定基因與著絲粒間的距離。,,96,,(1) PD=
47、①+,④,=270>>NPD=②=5,,∴,a,與,b,連鎖。,(2)出現(xiàn),③,類(lèi):a,→,MI,b→MII;,,但未出現(xiàn):,a,→,MII,b→MI,子囊,,∴,a,與,b,連鎖且位于同一染色體臂。,(3),出現(xiàn)④類(lèi):,a→MII,b→MII,,,,,③,類(lèi)是a與b單交換的結(jié)果,且只有a位于著絲粒和b之間才可能出現(xiàn)。,∴,a,位于著絲粒和,b,之間,。,,97,,19.4,b,a,7.5,,98,,5.5,,連鎖遺傳規(guī)律的應(yīng)用,5.5.1理論研究中的意義,,1. 基因與染色體的關(guān)系(基因論),,2. 生物變異產(chǎn)生的最重要的理論解釋之一,,3. 連鎖遺傳作圖的理論基礎(chǔ),,5.5.2育種改進(jìn)的理
48、論基礎(chǔ),,99,,念珠理論,——,經(jīng)典遺傳學(xué)的基因論,基因是一種化學(xué)實(shí)體,以念珠狀直線排列在染色體上,隨染色體復(fù)制,在有絲分裂和減數(shù)分裂中有規(guī)律地進(jìn)行分配,并具有相對(duì)穩(wěn)定性。,,1. 染色體是基因的載體或轉(zhuǎn)運(yùn)者,它允許基因有序別離與組合;,,2. 基因是最小重組單位,具有不可分性,交換只能發(fā)生在基因間;,,100,,3.,基因是最小,突變單位,,以一個(gè)整體進(jìn)行突變,內(nèi)部不再有可變化的更小組分;,,4.,基因是一個(gè),功能單位,。它控制有機(jī)體的某一個(gè)或一些性狀。,,可將重組單位和突變單位合稱(chēng)為結(jié)構(gòu)單位,因而基因既是一個(gè),結(jié)構(gòu)單位,,又是一個(gè),功能單位,。,,念珠理論,——,經(jīng)典遺傳學(xué)的基因論,,1
49、01,,5.5.2育種改進(jìn)的理論基礎(chǔ),1.可以利用連鎖性狀作為間接選擇的依據(jù),提高選擇結(jié)果,,2.設(shè)法打破基因連鎖:如輻射、化學(xué)誘變、遠(yuǎn)緣雜交、…,,3.可以根據(jù)交換率安排工作,,交換值大 重組型多 選擇時(shí)機(jī)大 育種群體小,,交換值小 重組型少 選擇時(shí)機(jī)小 育種群體大,,102,,例:,小麥抗白粉病基因P與一不利性狀基因d連鎖,遺傳距離為5。問(wèn):,,(1)當(dāng)要通過(guò)雜交、回交把P轉(zhuǎn)入到一個(gè)綜合性狀優(yōu)良地品種時(shí),至少需要多少回交一代植株,才能保證至少有一株抗白粉病但無(wú)不利基因d的植株?,,(2)對(duì)于自交F,2,群體呢?,,,,103,,解:(1)P Pd/Pd,×,pD/pD,↓,F,1,Pd/p
50、D,×,pD/pD,↓(配子),,,PD (2.5%) pD,,Pd (47.5%),,pD(47.5%),,pd(2.5%),,,(1-2.5%),n,=1%,→n=182(株),,104,,,,♂ ♀,Pd(47.5%),PD(2.5%),pd(2.5%),pD(47.5%),Pd,,(47.5%),Pd/ Pd,,(22.56%),Pd/PD,,(1.19%),Pd/pd (1.19%),Pd/pD (22.56%),PD,,(2.5%),PD/Pd (1.19%),PD/ PD (0.06%),PD/pd (0.06%),PD/pD (1.19%),pd,,(2.5%),Pd/pd (1.19%),pd/PD,,(0.06%),pd/pd (0.06%),pd/pD (1.19%),pD,,(47.5%),pD/Pd (22.56%),pD/PD,,(1.19%),pD/pd (1.19%),pD/pD (22.56%),,105,,本章重點(diǎn)和難點(diǎn),連鎖遺傳(包括完全連鎖和不完全連鎖)及其意義和驗(yàn)證方法;,,基因交換值的測(cè)定;,,基因定位的方法;,,染色體的基因連鎖圖繪制。,,,106,,
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