王鏡巖 生物化學(xué) 經(jīng)典課件 8代謝總論1 考研必備 學(xué)生物化學(xué)必備

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1、代謝總論第19章一、新陳代謝的一般規(guī)律一、新陳代謝的一般規(guī)律(一)基本概念 新陳代謝是體內(nèi)化學(xué)反應(yīng)的總稱(chēng),體內(nèi)的化學(xué)反應(yīng)通常由酶催化,一系列的連續(xù)反應(yīng)構(gòu)成代謝途徑,代謝途徑的個(gè)別步驟稱(chēng)作中間代謝,個(gè)別步驟的產(chǎn)物稱(chēng)作中間產(chǎn)物。新陳代謝的主要作用有: 獲取營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),并將其轉(zhuǎn)化為自身所需的物質(zhì),稱(chēng)作合成代謝; 分解營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)提供生命活動(dòng)所需的能量,稱(chēng)作分解代謝; 合成代謝和分解代謝的調(diào)控步驟通常由不同的酶催化,分解代謝中大量釋放能量的反應(yīng)通常是不可逆的,在合成代謝中,這樣的步驟需要輸入能量來(lái)完成。 有時(shí),合成代謝和分解代謝可以在不同的細(xì)胞器中進(jìn)行。 有些代謝環(huán)節(jié)是合成代謝和分解代謝共同利用的,稱(chēng)作兩用

2、代謝途徑,如檸檬酸循環(huán)就是兩用代謝途徑。(二)代謝途徑的一覽圖1點(diǎn)1線(xiàn)或1點(diǎn)2線(xiàn):410個(gè);1點(diǎn)3線(xiàn):71個(gè);1點(diǎn)4線(xiàn):20個(gè);1點(diǎn)5線(xiàn):11個(gè);1點(diǎn)6線(xiàn)或6線(xiàn)以上:8個(gè);1點(diǎn)1線(xiàn)在1個(gè)途徑的末端;1點(diǎn)2線(xiàn)在1個(gè)途徑的中間;1點(diǎn)3線(xiàn)參與2個(gè)途徑;其余類(lèi)推。(三)代謝途徑的類(lèi)型:(a)多種游離酶構(gòu)成的代謝途徑;(b)多酶復(fù)合體構(gòu)成的代謝途徑;(c)膜結(jié)合酶構(gòu)成的代謝途徑。(四)分解代謝的三個(gè)階段(五)能量代謝在新陳代謝中的重要地位(六)輔酶I和輔酶的的遞能作用(七)FMN和FAD的遞能作用(八)輔酶A在能量代謝中的作用(九)分解代謝和合成代謝的調(diào)控代謝途徑的區(qū)域化細(xì)胞提取液的離心分離二、代謝中常

3、見(jiàn)的有機(jī)反應(yīng)機(jī)制二、代謝中常見(jiàn)的有機(jī)反應(yīng)機(jī)制 有機(jī)化學(xué)反應(yīng)常涉及共價(jià)鍵的斷裂。 共價(jià)鍵斷裂時(shí),若兩個(gè)電子分開(kāi),稱(chēng)作均裂斷裂,產(chǎn)生不穩(wěn)定基團(tuán),常見(jiàn)于氧化還原反應(yīng)。 若兩個(gè)電子不分開(kāi),稱(chēng)作異裂斷裂,如C-H鍵斷裂,電子對(duì)通常留在碳原子一側(cè)(碳原子的電負(fù)性大于氫原子),形成碳負(fù)離子和氫離子,富電子的碳負(fù)離子為親核基團(tuán),容易與缺電子的親電基團(tuán)發(fā)生反應(yīng)。 若有氫負(fù)離子的受體存在,C-H鍵斷裂時(shí)電子有可能留在氫原子一側(cè)形成碳正離子和氫負(fù)離子,缺電子的親電基團(tuán)容易與富電子的碳負(fù)離子(為親核基團(tuán))發(fā)生反應(yīng)。(一)基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng)(grouptransferreaction) 在生物化學(xué)反應(yīng)中,通常為親電基團(tuán)從一個(gè)

4、親核體轉(zhuǎn)移到另一個(gè)親核體常見(jiàn)的轉(zhuǎn)移基團(tuán)有?;⒘柞;推咸烟腔?。1.?;D(zhuǎn)移2.磷?;D(zhuǎn)移3.葡糖基轉(zhuǎn)移(二)氧化反應(yīng)和還原反應(yīng) (oxidation and reduction) 實(shí)質(zhì)是電子的得失,在生物化學(xué)反應(yīng)中十分普遍,從代謝物轉(zhuǎn)移的電子,通過(guò)一系列的傳遞體轉(zhuǎn)移到氧,并伴隨能量的釋放。(三)消除、異構(gòu)化及重排反應(yīng) 消除反應(yīng)伴隨碳-碳雙鍵的生成,可通過(guò)協(xié)同機(jī)制、碳正離子機(jī)制或碳負(fù)離子機(jī)制完成,形成順式或反式消除產(chǎn)物。 在生物化學(xué)中,常見(jiàn)的異構(gòu)化反應(yīng)是雙鍵移位。如酮糖-醛糖互變。 重排反應(yīng)伴隨碳-碳鍵的斷裂和重生成,使碳骨架發(fā)生變化。1.消除反應(yīng)消除反應(yīng)的機(jī)制2.異構(gòu)化反應(yīng)1212消除反應(yīng)

5、的立體化學(xué)(四)碳-碳鍵的形成與斷裂反應(yīng) 分解代謝和合成代謝以碳-碳鍵的形成與斷裂為基礎(chǔ),常見(jiàn)的有: 1.羥醛縮合反應(yīng)和羥醛裂解反應(yīng),如果糖-1,6-二磷酸裂解為二羥丙酮磷酸和甘油醛-3-磷酸。 2.克萊森酯縮合反應(yīng)如檸檬酸合酶催化的反應(yīng)(在檸檬酸循環(huán)中介紹)。 3.-酮酸的氧化脫羧反應(yīng)如異檸檬酸的氧化脫羧。三、新陳代謝的研究方法 (一)使用酶的抑制劑(一)使用酶的抑制劑 微生物的營(yíng)養(yǎng)缺陷型可以分為若干種亞型,每種亞型由一種酶的缺陷造成,對(duì)比研究可以搞清代謝途徑。如途徑A B C D中B C 的酶缺失,則A和B會(huì)堆積, C D的酶缺失,則A,B和C會(huì)堆積。(二 )利用遺傳缺欠癥研究代謝途徑(三

6、)同位素示蹤法 用14C標(biāo)記CO2,培養(yǎng)綠藻,提取液進(jìn)行雙向紙層析,放射自顯影,發(fā)現(xiàn)放射性最早出現(xiàn)在3-磷酸甘油酸(PGA),隨后出現(xiàn)在其他中間物。(四)核磁共振波譜法 磷酸肌酸運(yùn)動(dòng)19分鐘前后ATP和磷酸肌酸的變化情況基本要求 1.掌握分解代謝與合成代謝及與能量代謝的關(guān)系。 (重點(diǎn)) 2.掌握輔酶I、輔酶、FMN、FAD和輔酶A在能量代謝中的作用。(重點(diǎn)) 3.掌握新陳代謝調(diào)節(jié)的一般規(guī)律。(重點(diǎn)) 4.了解代謝中常見(jiàn)的有機(jī)反應(yīng)機(jī)制。 5.熟悉新陳代謝的研究方法。生物能學(xué) 第20章 一、有關(guān)熱力學(xué)的一些基本概念一、有關(guān)熱力學(xué)的一些基本概念(一)體系的概念、性質(zhì)和狀態(tài) (二)能的兩種形式: 熱與

7、功(三)內(nèi)能和焓的概念(四)熱力學(xué)第一定律 U = Q W, 等壓時(shí): U = dQ PdV(五)化學(xué)能的轉(zhuǎn)化(六)熱力學(xué)第二定律和熵的概念 對(duì)于隔離體系 S = S體系 + S環(huán)境 0(七)自由能的概念 dG = VdP SdT dW ,等溫時(shí): dG = VdP dW , 等溫且等壓時(shí): G = W 即自由能是等溫且等壓條件下,體系做有用功的能力。隔離體系封閉體系開(kāi)放體系二、化學(xué)反應(yīng)中自由能的變化和意義(一)化學(xué)反應(yīng)的自由能變化公式 G = H TS(二)標(biāo)準(zhǔn)自由能變化和化學(xué)平衡的關(guān)系 對(duì)化學(xué)反應(yīng) aA+bB cC+dD 達(dá)到化學(xué)平衡時(shí)(三)標(biāo)準(zhǔn)生成自由能及其應(yīng)用 G0= G0f產(chǎn)物 G0

8、f反應(yīng)物(四)偶聯(lián)化學(xué)反應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)自由能變化的可加性及其意義 偶聯(lián)化學(xué)反應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)自由能變化是可以相加的, 如:AB+C 的 G0 = +21kj/mol, BD的 G0 = -34kj/mol, 則 A C+D 的 G0 = -13kj/mol, 反應(yīng)可以自發(fā)進(jìn)行。(五)化學(xué)反應(yīng)和自由能關(guān)系的進(jìn)一步說(shuō)明 只有G0的反應(yīng)可以和G0的反應(yīng),在非標(biāo)準(zhǔn)狀態(tài)下,G有可能0。 (3) 熱力學(xué)第二定律只能確定反應(yīng)的方向和限度,不能預(yù)示反應(yīng)過(guò)程的速率,許多G0的反應(yīng),需要提供活化能或使用催化劑才能使反應(yīng)實(shí)際發(fā)生。(六)能量學(xué)用于生物化學(xué)反應(yīng)中的一些規(guī)定 (1)水作為反應(yīng)物或產(chǎn)物時(shí),水的濃度通常規(guī)定為1(實(shí)際濃度約為

9、55.5mol/L)。 (2)生物體系的pH規(guī)定為7.0,稱(chēng)作生物體系的標(biāo)準(zhǔn)自由能變化,用G0表示。如果反應(yīng)體系的pH不等于7.0,就不能使用G0。 (3)標(biāo)準(zhǔn)自由能的單位用 kj/mol 表示。(七)G0、G以及平衡常數(shù)計(jì)算的舉例(教科書(shū)P33)三、高能磷三、高能磷酸化合物酸化合物1.磷氧鍵型2.氮磷鍵型3.硫酯鍵型(三)ATP的結(jié)構(gòu)特性 相鄰正電荷的電子排斥作用乙酸酐的多種共振形式ATP水解為 ADP釋放靜電排斥力; ATP和水轉(zhuǎn)化為ADP,無(wú)機(jī)磷酸和質(zhì)子使熵增加。黃色表示可以解離的氫(四)細(xì)胞內(nèi)影響ATP自由能釋放的因素 ATP和ADP均由多種解離形式,并且可以同金屬離子相互作用,這些引均可影響自由能的釋放。ATP水解釋放自由能與pH的關(guān)系A(chǔ)TP水解釋放自由能與Mg2+的關(guān)系(pH 7.0,38oC)ATP水解釋放自由能與其濃度的關(guān)系(pH 7.0, 38oC)(五)ATP在能量轉(zhuǎn)運(yùn)中的地位和作用(六)磷酸肌酸和磷酸精氨酸及其他貯能物質(zhì) 由PEP生成丙酮酸釋放大量自由能

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