中山大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館數(shù)據(jù)庫檢索指南.doc

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中山大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館數(shù)據(jù)庫檢索指南Sun Yat-sen University Library Guide SciFinder Scholar (CA)化學(xué)文摘網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(學(xué)術(shù)版)一、數(shù)據(jù)庫介紹化學(xué)文摘是化學(xué)和生命科學(xué)研究領(lǐng)域中不可或缺的參考和研究工具，也是資料量最大，最具權(quán)威的出版物。網(wǎng)絡(luò)版化學(xué)文摘SciFinder Scholar，更整合了Medline醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫、歐洲和美國(guó)等30幾家專利機(jī)構(gòu)的全文專利資料、以及化學(xué)文摘1907年至今的所有內(nèi)容。它涵蓋的學(xué)科包括應(yīng)用化學(xué)、化學(xué)工程、普通化學(xué)、物理、生物學(xué)、生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、聚合體學(xué)、材料學(xué)、地質(zhì)學(xué)、食品科學(xué)和農(nóng)學(xué)等諸多領(lǐng)域。SciFinder Scholar可檢索數(shù)據(jù)庫包括： 數(shù)據(jù)庫內(nèi)容 Reference Databases （文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫）CAPLUSSM包含來自150 多個(gè)國(guó)家、9000 多種期刊的文獻(xiàn)，覆蓋1907 年到現(xiàn)在的所有文獻(xiàn)以及部分1907 年以前的文獻(xiàn)，包括有期刊、專利、會(huì)議錄、論文、技術(shù)報(bào)告、書等，涵蓋化學(xué)、生化、化學(xué)工程以及相關(guān)學(xué)科，還有尚未完全編目收錄的最新文獻(xiàn)。（目前2,430 萬條參考書目記錄，每天更新3000 條以上）MEDLINE 包含來自70 多個(gè)國(guó)家、3900 多種期刊的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)，覆蓋1951 到現(xiàn)在的所有文獻(xiàn)，以及尚未完全編目收錄的最新文獻(xiàn)。（目前1300 萬參考書目記錄，每周更新4 次） Structure Database （結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫）REGISTRYSM涵蓋從1957 年到現(xiàn)在的特定的化學(xué)物質(zhì)。REGISTRY 包括了在CASM中引用的物質(zhì)以及特定的注冊(cè)。（目前7400 萬條物質(zhì)記錄，每天更新約7 萬條，每種化學(xué)物質(zhì)有唯一對(duì)應(yīng)的CAS 注冊(cè)號(hào)） Reaction Database （反應(yīng)數(shù)據(jù)庫）CASREACT 包括從1907 年到現(xiàn)在的單步或多步反應(yīng)信息。CASREACT 中的反應(yīng)包括CAS 編目的反應(yīng)以及下列來源：ZIC/VINITI 數(shù)據(jù)庫，INPI1986 年以前的數(shù)據(jù)，以及由教授Klaus Kieslich 博士指導(dǎo)編輯的生物轉(zhuǎn)化數(shù)據(jù)庫。（目前800 萬條反應(yīng)記錄和403,000 條文獻(xiàn)記錄 ，每周更新約700-1300 條） Commercial Sources Database （商業(yè)來源數(shù)據(jù)庫）CHEMCATS 化學(xué)品的來源信息，包括化學(xué)品目錄手冊(cè)以及圖書館等內(nèi)的供應(yīng)商的地址、價(jià)格等信息。（目前740 萬條商業(yè)化學(xué)物質(zhì)記錄，來自655 家供應(yīng)商的793 種目錄） Regulatory Database ( 管制數(shù)據(jù)庫)CHEMLIST 1979 年到現(xiàn)在的管制化學(xué)品的信息，包括物質(zhì)的特征、詳細(xì)目錄、來源以及許可信息等。（22.8 萬種化合物的詳細(xì)清單，來自13 個(gè)國(guó)家和國(guó)際性組織，每周更新50 條新記錄）我校也購有CA光盤版，包括1997年至2003年5月的數(shù)據(jù)。 二、SciFinder Scholar (CA)客戶端程序的安裝和運(yùn)行SciFinder Scholar （CA）數(shù)據(jù)庫初次使用需要運(yùn)行安裝客戶端程序，其安裝步驟如下：（一）安裝客戶端程序 (1) 客戶端程序地址：ftp:/202.116.69.14/sfs-new.rar，對(duì)文件 sfs-new.rar 進(jìn)行解壓縮，可看到ViewerLite5_04.exe, SFS2004-2.exe和site.prf三個(gè)文件* 對(duì)于曾下載并安裝sfs舊版本的用戶：sfs2004-2.exe文件為原來的sfs2004.exe的更新版本，用戶只需在卸載原程序sfs2004.exe程序后安裝程序更新版本sfs2004-2.exe到原安裝目錄文件夾內(nèi)。 * 對(duì)于未曾下載sfs舊版本的用戶：可按照接下來的步驟進(jìn)行安裝；1. 關(guān)閉其他應(yīng)用程序。2. 運(yùn)行SFS2004-2.exe，按照系統(tǒng)的提示安裝客戶端軟件。建議選用典型安裝。3. 安裝過程中系統(tǒng)提問“Do you have a disk labeled custom site files?”時(shí)，請(qǐng)選擇“否”。其它選擇項(xiàng)默認(rèn)，完成客戶端軟件SFS2004-2.exe的安裝。（二）配置客戶端軟件將解壓縮后得到的文件site.prf復(fù)制到客戶端軟件安裝的目錄區(qū)內(nèi)（默認(rèn)路徑為C:SFSCHLR）。如果用戶在安裝過程中選擇了其他路徑，請(qǐng)注意路徑和目錄。（三）安裝ViewerLiteViewerLite是一個(gè)觀看三維結(jié)構(gòu)的工具，在SciFinder Scholar檢索出的物質(zhì)結(jié)果中，有很多都是提供3D視圖的，如果安裝了ViewerLite,直接點(diǎn)擊物質(zhì)名上的三維圖像按鈕即可查看。用戶可自行選擇是否安裝：運(yùn)行解壓縮后得到的文件ViewerLite5_04.exe，按系統(tǒng)提示完成安裝。（四）訪問SciFinder Scholar數(shù)據(jù)庫(1) 專線訪問。(2) 運(yùn)行SciFinder Scholar客戶端程序：開始程序SciFinder Scholar 2004 EditionSciFinder Scholar(3)開始檢索。（五）需經(jīng)由代理訪問的IP使用 SciFinder Scholar 方法凡非正式IP，需經(jīng)由代理服務(wù)器訪問校外網(wǎng)絡(luò)的用戶，經(jīng)與學(xué)校網(wǎng)絡(luò)中心的老師溝通，目前只能通過架設(shè)代理層訪問SciFinder Scholar。步驟如下：(1) 下載 SocksCap 軟件并安裝，SocksCap 需要定期更新，請(qǐng)留意更新時(shí)間。目前提供其一下載地址：SocksCaP（ftp:/202.116.69.14/sc32r237.exe）(2) 啟動(dòng) SocksCap 軟件，F(xiàn)ile中選擇“Setting”，在 SOCKS Server 中填寫所使用的代理服務(wù)器，如proxy2.zsu.edu.cn；在Port中填寫端口，如1080。（因各校區(qū)代理服務(wù)器地址和端口各不相同，請(qǐng)用戶查閱網(wǎng)絡(luò)中心發(fā)的校園網(wǎng)用戶管理手冊(cè)）。 Protocol選擇 SOCKS 5，其他默認(rèn)。(3) 啟動(dòng) SocksCap 軟件，點(diǎn)擊“New”，出現(xiàn)“新運(yùn)行程序”對(duì)話框后，點(diǎn)擊“Browse.”，在彈出選擇框內(nèi)選擇在客戶端軟件所安裝的目錄區(qū)（默認(rèn)路徑為C:SFSCHLR），然后在其中選擇 sfschlr.exe 程序，然后確定即可。在 SocksCap 內(nèi)運(yùn)行 sfschlr 即進(jìn)行連接。注意：本數(shù)據(jù)庫并發(fā)用戶為5人，北校區(qū)等通過代理訪問的用戶連接速度較慢，如果暫時(shí)連接不上，請(qǐng)耐心等候。三、SciFinder Scholar 使用的簡(jiǎn)單介紹：(一) 進(jìn)入數(shù)據(jù)庫雙擊SciFinder Scholar圖標(biāo)，在License Agreement的彈出窗口中，用戶選擇Accept按鈕， 關(guān)掉Message of day的彈出窗口，就進(jìn)入了Science Finder Scholar的Explore主檢索界面，見圖2。點(diǎn)擊工具條的第一個(gè)圖標(biāo)New task，也可以得到Explore界面，見圖1。工具條包括常用的一些功能：新任務(wù)，后退，向前，打印，保存，全文獲取，參數(shù)設(shè)置，數(shù)據(jù)庫，歷史紀(jì)錄，網(wǎng)址，幫助，退出程序。參數(shù)設(shè)置新任務(wù)數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址圖1 公司名稱和研究機(jī)構(gòu)瀏覽目錄研究主題文獻(xiàn)情報(bào)著者姓名化學(xué)物質(zhì)或化學(xué)反應(yīng)圖2 (二) SciFinder Scholar的檢索方法SciFinder Scholar提供六種基本檢索途徑(見圖二)，下面簡(jiǎn)要介紹各種途徑的使用：1、 化學(xué)物質(zhì)或化學(xué)反應(yīng)（Chemical Substance or Reaction）用戶可以選擇三種途徑檢索： 化學(xué)結(jié)構(gòu)式（Chemical Structure）您可以在CAS的2200萬種有機(jī)和無機(jī)物質(zhì)的注冊(cè)中，查找結(jié)構(gòu)匹配項(xiàng)。要按結(jié)構(gòu)檢索，只需使用結(jié)構(gòu)繪圖窗口繪制、導(dǎo)入或者“粘貼”您要檢索的化學(xué)結(jié)構(gòu)。如圖3，畫出Ibuprofen 的結(jié)構(gòu)，單擊“Get Substances（獲取化學(xué)物質(zhì)）”，然后選擇確切的匹配項(xiàng)或相關(guān)結(jié)構(gòu)，單擊OK。圖3您可單擊CAS注冊(cè)號(hào)上方顯示的任何按鈕，查看相關(guān)物質(zhì)的更多信息。點(diǎn)擊AB，彈出窗口，選擇該物質(zhì)在反應(yīng)中的位置，如選擇Product，則將Ibuprofen作為產(chǎn)物的反應(yīng)檢索出來。如下圖4：獲取反應(yīng)管制化學(xué)品商業(yè)來源信息物質(zhì)的引文物質(zhì)的3D 模型圖4圖5也可以點(diǎn)擊反應(yīng)式中的任何物質(zhì)獲取更多信息，如果點(diǎn)擊Reactions，則彈出選項(xiàng)，這里我們選擇了Substance Detail，提供CAS Registry 記錄，點(diǎn)擊其中的超鏈接，可以查看得到此結(jié)果的參考文獻(xiàn)內(nèi)容。圖5、6。Get References 可以獲取相關(guān)文獻(xiàn)，Analyze/Refine 可以對(duì)結(jié)果進(jìn)行分析或二次檢索。圖6您可以通過繪制化學(xué)結(jié)構(gòu)，限定反應(yīng)中的作用，從700多萬種反應(yīng)中查找相匹配的信息。使用結(jié)構(gòu)繪圖板繪制您的反應(yīng)查詢。添加反應(yīng)箭頭，制定反應(yīng)參與項(xiàng)的作用。請(qǐng)單擊“Get Reaction（獲取反應(yīng)）”。單擊任何反應(yīng)參與項(xiàng)，獲得該物質(zhì)的更多詳情。要確認(rèn)該物質(zhì)是否已投入市場(chǎng)、購買地點(diǎn)、銷售價(jià)格，請(qǐng)單擊“Commercial Sources（商業(yè)資源）”。您將看到供應(yīng)商列表。單擊“顯微鏡”圖標(biāo)，屏幕將提供有關(guān)供應(yīng)商的詳細(xì)信息，包括地址、電話、傳真號(hào)碼、電子郵件地址等連連信息。如果您選擇部分結(jié)構(gòu)檢索功能，SciFinder Scholar為您提供新的結(jié)構(gòu)檢索可能性。使用機(jī)構(gòu)繪圖板繪制相關(guān)子結(jié)構(gòu)。定義立體結(jié)合、環(huán)狀構(gòu)造、鏈鎖結(jié)構(gòu)、替換和取待基團(tuán)。單擊“Get Substances（獲取物質(zhì)）”并指定子結(jié)構(gòu)。單擊OK。如果結(jié)構(gòu)繪圖包含立體結(jié)構(gòu)。SciFinder Scholar將通過與您的查詢進(jìn)行比較自動(dòng)分析您的答案。選擇所需的組要進(jìn)一步精確查明答案，單擊“Analyze/Refine（分析/精調(diào)）”?！癆nalyze”為您提供若干選項(xiàng)。例如可選擇“Ring Skeletons（環(huán)狀構(gòu)造）”。單擊OK。SciFinder Scholar將根據(jù)同一環(huán)狀構(gòu)造中特定的原子和結(jié)合，對(duì)答案集中的物質(zhì)進(jìn)行分析和分組。 物質(zhì)標(biāo)識(shí)符 （Substance Identifier）您可以從2200萬種有機(jī)和無機(jī)的物質(zhì)中按化學(xué)名稱或CAS注冊(cè)號(hào)查找相關(guān)物質(zhì)。通過物質(zhì)標(biāo)識(shí)符進(jìn)行檢索，輸入一個(gè)或多個(gè)通用名稱、物質(zhì)別名或CAS注冊(cè)號(hào),例如：50-00-0；Acetaminophen，單擊OK。SciFinder Scholar將檢索與您的物質(zhì)標(biāo)識(shí)符相對(duì)應(yīng)的CAS注冊(cè)記錄。 分子式 （Molecular Formula）通過分子式進(jìn)行檢索，SciFinder Scholar 會(huì)分析您所輸入的分子式，并重新編排原子，使之成為能被計(jì)算機(jī)識(shí)別的Hill System Order，搜索CAS Registry 數(shù)據(jù)庫，并顯示匹配結(jié)果；如果輸入的原子是模糊的，則彈出窗口提示修改，如元素符號(hào)的上標(biāo)、下表，元素符號(hào)之間以空格隔開等（多數(shù)情況下會(huì)自動(dòng)修正）；如果是多組分的物質(zhì)如聚合物，鹽類等，則各個(gè)組分之間以英文的句號(hào) . 隔開。如Component1.Component2。2、 研究主題（Research Topic）您可以使用描述相關(guān)主題的詞句或詞語，查找CAS數(shù)據(jù)庫中的2300萬參考文獻(xiàn)和MEDLINE中的1340萬種參考文獻(xiàn)。在“Explore by Research Topic”框中輸入描述您的研究主題的單詞或短語，例如：the effect of antibiotic residues on dairy products。選擇Additional Options按鈕可以從出版年、文獻(xiàn)類型、語種、著者、公司名稱五個(gè)方面進(jìn)行限制。Remove Options按鈕可以回到原來的簡(jiǎn)單主題檢索。得到若干候選主題主題詞之間的邏輯組配，見圖7。可進(jìn)行多選。選擇合適主題，單擊Get Reference以檢索全部參考文獻(xiàn)。圖7圖8截取了部分相關(guān)文獻(xiàn)結(jié)果，單擊右邊有“顯微鏡”的圖標(biāo)，可以查看完整的書目詳情及相關(guān)參考文獻(xiàn)的摘要。單擊“電腦”圖標(biāo)，可以查看全文。SciFinder Scholar通過ChemPort連接雜志和專利原文。如果是已經(jīng)訂閱或開放的電子文獻(xiàn)，就可以直接查看全文，當(dāng)然也有可能出現(xiàn)要求付費(fèi)才能查看的頁面。Chemport提供了SciFinder收錄的100多年來的許多期刊的全文鏈接，其中核心期刊1870余種（即每一期每篇文章都有鏈接，最新的核心期刊列表請(qǐng)?jiān)L問http:/www.cas.org/sent.html 查看）SciFinder Scholar 是每天更新的數(shù)據(jù)庫，所以很多最新的全文鏈接也一直被添加進(jìn)來。SciFinder Scholar中包含了近五百萬條專利記錄，其涵蓋范圍請(qǐng)參看http:/www.cas.org/EO/caspat.html 。大部分專利全文都可以在網(wǎng)上免費(fèi)獲得，Chemport也提供了相應(yīng)的鏈接。文摘全文圖8Analyze/Refine按鈕，可以Analyze對(duì)所選文獻(xiàn)按照年、機(jī)構(gòu)來源、著者等進(jìn)行分析得到直方圖（histogram）；或者Refine從研究主題、機(jī)構(gòu)名稱、著者名稱、出版年、文獻(xiàn)類型、語種、數(shù)據(jù)庫、是否可獲取全文八個(gè)方面對(duì)已有的結(jié)果進(jìn)行二次檢索。Get Related可以查看關(guān)聯(lián)信息：所選文獻(xiàn)引用的文獻(xiàn)（Cited Reference），引用所選文獻(xiàn)的文獻(xiàn)（Citing Reference）， 所選文獻(xiàn)中的物質(zhì)（Substance）， 所選文獻(xiàn)中的反應(yīng)（Reactions），eScience 可以將您的檢索擴(kuò)展到整個(gè)網(wǎng)絡(luò)。3、 著者姓名（Author Name）1907年至今化學(xué)和相關(guān)領(lǐng)域內(nèi)任何作者出版的研究文獻(xiàn)，均可通過SciFinder Scholar檢索。輸入作者姓名時(shí)，請(qǐng)記住一定要輸入姓氏（Last Name），名字或中間名是可選項(xiàng)。SciFinder Scholar將提供您所需作者姓名的所有姓氏，包括其它拼寫。對(duì)于復(fù)姓如OSullivan, Chace-Scott, or Johnson Taylor可直接輸入；如果帶有元音變音的，輸入字母即可，或在后面接一個(gè)e，會(huì)同時(shí)搜索名、姓以及姓、名；對(duì)于不確認(rèn)的名，可以輸入首字母。4、 文件標(biāo)識(shí)（Document Identifier）如果您可提供專利號(hào)，SciFinder Scholar能夠?qū)⒛B接到其電子版本。用專利號(hào)進(jìn)行檢索，單擊“Document Identifier（文獻(xiàn)情報(bào)）”，在檢索框中鍵入專利號(hào)，一次可輸入多個(gè)，分行輸入。也可以按單擊“Read from file”按鈕從文件中導(dǎo)入專利號(hào)。單擊“顯微鏡”圖標(biāo)，可以查看專利的詳情。單擊“電腦”圖標(biāo)，可以通過ChemPort Connection SM鏈接至網(wǎng)站中的電子版專利。下表列出了一些常用的文件標(biāo)識(shí)：NumberExamplesCA Accession Number120:152971994:15297Patent numberCA 2107100Patent application numberJP 1992-502228Priority application numberIT 1998-BO661PubMed ID(National Library of Medicine)20041235、 公司名稱和研究機(jī)構(gòu)（Company Name/Organization）SciFinder Scholar讓您可輕易地尋找所在研究領(lǐng)域的競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手或同事。要按公司或組織進(jìn)行檢索，單擊“Company Name/Organization”，輸入您要檢索的組織名稱。要查找該組織是否針對(duì)相關(guān)主題進(jìn)行了研究，請(qǐng)使用SciFinder Scholar地“Refine（精調(diào)）工具，圖9。單擊“Research Topic”輸入您的主題。SciFinder Scholar的“Analyze（分析）”工具，可進(jìn)一步確定該組織中是否已有人擁有相關(guān)主題的專利。選擇“Document Type（文檔類型）”，單擊OK。SciFinder Scholar將提供與相關(guān)組織關(guān)聯(lián)的所有文檔類型。要查看專利參考信息的詳情，請(qǐng)選“Patent（專利）”，然后單擊“Get Reference（獲取參考文獻(xiàn)）”。您可使用任何SciFinder Scholar選項(xiàng)，查看不同類型參考文獻(xiàn)。圖96、 瀏覽目錄（Browse Table of Contents）使用SciFinder Scholar，您可查看1700多種流行科學(xué)期刊的目錄，了解已出版的雜志文獻(xiàn)。從1700多種雜志按字母順序的列表中查找選擇您喜愛的雜志，單擊“View”。也可通過Edit 菜單Find，查找所需期刊，注意名稱必須完全匹配，一次只能查看一種期刊。默認(rèn)結(jié)果顯示的是最新一期的目錄，Previouse、Next、Select 可以瀏覽其他期的目錄內(nèi)容。單擊“Select Issue（選擇期刊）”，可選擇卷冊(cè)和期刊號(hào)。瀏覽期刊的標(biāo)題，查找相關(guān)文章。要查看書目詳情和文章摘要，請(qǐng)單擊“顯微鏡”圖標(biāo)。查看文章全文的電子版，單擊“電腦”圖標(biāo)。以上對(duì)SciFinder Scholar 的使用作一個(gè)簡(jiǎn)單介紹，更多的內(nèi)容可以參見SciFinder Scholar的幫助文件，菜單中的Help，或F1。中山大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館參考咨詢部聯(lián)系電話:020-87330445，87330804電子郵件: fmlrgzsums.edu.cn